Il problema che si è verificato alla stazione pisana ha creato notevoli disagi sulla linea per Firenze e su quella per Lucca, mettendo in difficoltà centinaia di pendolari, molti dei quali hanno atteso a lungo a bordo delle carrozze che l'emergenza terminasse. Per alcune destinazioni, come Lucca, sono stati organizzati autobus sostitutivi.
Disagi anche all'aeroporto di Peretola per la cancellazione di un volo in arrivo da Zurigo e della tratta di ritorno da Firenze alla città svizzera.