L'Ato Toscana sud è stata la prima a bandire una gara di appalto per individuare un unico gestore del servizio di raccolta e smaltimento rifiuti in 103 Comuni toscani. E proprio il bando di gara, secondo quanto pubblicato da Massimo Vanni sul quotidiano La Repubblica, è al centro dell'inchiesta della procura di Firenze sia sul vincitore dell'appalto decretato nel 2013, il raggruppamento di imprese Sei Toscana, che sui consulenti che hanno lavorato alla predisposizione del bando.
Gli indagati sarebbero sette. L'ipotesi di reato è turbativa d'asta.
La gara è stata ripetutamente oggetto di interrogazioni ed esposti degli esponenti del Movimento 5 Stelle.